Le choix d’un traitement antibiotique empirique adapté repose sur plusieurs facteurs qu’il convient d’évaluer :

• Le foyer infectieux le plus probable (site)
• Les bactéries pathogènes les plus fréquentes pour ce site (que l'antibiotique administré devra couvrir)
• Le spectre antibiotique le plus adapté à ces bactéries (selon leurs résistances naturelles) (voir fiches antibiotiques)
• Le risque de germes résistants

Si pour le dernier point, certains facteurs de risque doivent être identifiés (séjour récent dans un hôpital étranger, antibiothérapies préalables, portage connu de BMR), le spectre antibiotique le plus adapté doit être également dicté par la connaissance de l’épidémiologie locale des résistances antibiotiques acquises, en constante évolution : le site infect.info (voir) vous guidera et vous donnera des informations au plus proche de la réalité épidémiologique actuelle en Suisse.

Au-delà de ces constats, cet article vous propose un résumé non exaustif des principaux pathogènes en cause dans les infections couramment rencontrées dans le milieu communautaire et nosocomial.

Otite moyenne aiguë, sinusite, exacerbation de BPCO :

Infection communautaire : Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenza, Branhamella catarrhalis

Pneumonie aiguë :

Infection communautaire : Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenza, Moraxella sp, germes atypiques (Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia sp, Legionnella sp)

Infection nosocomiale : Staphylococcus aureus, enterobactéries, Pseudomonas aeruginosa

Infection urinaire :

Infection communautaire et nosocomiale : entérobactéries (E.Coli, Klebsiella sp, Proteus sp), entérocoques

Infection digestive, biliaire, péritonéale :

Infection communautaire : entérobactéries, entérocoques, bactéries anaérobes

Infection nosocomiale : entérobactéries, Pseudomonas aeruginosa, entérocoques, bactéries anaérobes

Infection cutanée (érysipèle, dermo-hypodermite) :

Infection communautaire : Streptococcus pyogenes du groupe A, Staphylococcus aureus

Infection de cathéter :

Infection nosocomiale : Straphylococcus aureus, Staphylocoque coagulase négatif